中文Nueva variante del coronavirus 501Y-V2 de Sudáfrica
El 18 de diciembre de 2020, Sudáfrica detectó un mutante 501Y-V2 del nuevo coronavirus.Ahora el mutante sudafricano se ha extendido a más de 20 países.Los experimentos han demostrado que los mutantes del nuevo coronavirus pueden portar otras variantes del nuevo coronavirus de las mutaciones K417N/T, E484K y N501Y que pueden reducir la capacidad neutralizante de los anticuerpos neutralizantes del plasma inducidos por la vacuna.Sin embargo, en comparación con el genoma de referencia Wuh01 (número de secuencia MN908947), la secuencia del genoma mutante sudafricano 501Y.V2 tiene 23 variantes de nucleótidos.Tiene la misma mutación N501Y que el subtipo B.1.1.7 mutante británico, pero aún contiene mutaciones en dos sitios clave, E484K y K417N de la proteína S, que tienen efectos potencialmente importantes sobre la capacidad del virus para infectar.
El Nuevo Coronavirus es un Virus de ARN monocatenario, cuyo genoma presenta mutaciones más frecuentes.La detección de un solo objetivo puede provocar fácilmente que se omita la detección de muestras con baja carga viral y cepas de virus mutadas.La tasa de reexamen en el único positivo en la detección del objetivo puede alcanzar más del 10%, lo que puede aumentar la carga de trabajo y prolongar el tiempo de diagnóstico.La detección de múltiples objetivos y la verificación mutua de los resultados de cada objetivo pueden aumentar la tasa de detección y facilitar el diagnóstico temprano.
Figura 1. Diagrama esquemático del mecanismo de infección del Nuevo Coronavirus
Nuevo coronavirus mutante B.1.1.7 de Gran Bretaña
El 26 de diciembre de 2020 se publicó en línea el primer artículo científico de la cepa B.1.1.7.El Instituto de Higiene de la Universidad de Londres, Reino Unido y Enfermedades Tropicales, confirmó que la cepa B.1.1.7 es más capaz de propagarse que otras cepas, lo cual fue más del 56% (IC del 95%: 50-74%).Debido a que esta nueva cepa mutante tiene un poder de transmisión más evidente, se ha vuelto más difícil controlar el COVID-19.Al día siguiente, la Universidad de Birmingham en el Reino Unido subió un artículo sobre MedRxiv.El estudio encontró que el número de copias de los genes del virus ORF1ab y N en pacientes infectados con la cepa mutante B.1.1.7 (abandono del gen S) aumentó significativamente;este fenómeno fue monitoreado en la población.Este artículo señala que los pacientes infectados con el mutante B.1.1.7 de Gran Bretaña tienen una carga viral significativamente mayor, por lo que este mutante también puede ser más patógeno.
Figura 2. La secuencia de mutación del genoma contenida en la cepa mutante de coronavirus B.1.1.7 de Gran Bretaña.
Figura 3. La mutación N501Y ocurrió tanto en Gran Bretaña como en Sudáfrica.Variantes
Kit de detección de nuevas variantes del coronavirus
Chuangkun Biotech Inc. ha desarrollado con éxito un kit de detección para las nuevas variantes del coronavirus B.1.1.7 y 501Y-V2.
Ventajas de este producto: alta sensibilidad, detección simultánea de 4 objetivos, que cubren los principales sitios de mutación de la cepa mutante B.1.1.7 y la cepa mutante sudafricana 501Y.V2.Este kit puede detectar simultáneamente los sitios de mutación N501Y, HV69-70del, E484K y el nuevo gen S del coronavirus;Prueba rápida: solo se necesitan 1 hora y 30 minutos desde la toma de la muestra hasta el resultado.
Figura 4. Detección de la curva de amplificación de la variante británica de COVID-19
Figura 5. Detección de la curva de amplificación de la variante sudafricana de COVID-19
Figura 6. Curva de amplificación del nuevo coronavirus de tipo salvaje
No está claro cómo estas mutaciones acumulan el nuevo impacto a largo plazo de la pandemia de COVID-19.Pero esto nos recuerda que estas mutaciones pueden afectar la eficacia de la inmunidad natural y la inmunidad provocada por la vacunación.También nos recuerda que debemos monitorear continuamente el nuevo coronavirus durante mucho tiempo y actualizar la vacuna COVID-19 para hacer frente a la evolución del nuevo coronavirus.
Hora de publicación: 12-mar-2021